近日，我室海洋生物遗传资源重点实验室骆祝华课题组在国际环境领域知名学术期刊《Science of the Total Environment》（中科院二区top, IF=10.753）上发表海水养殖环境微生物重要研究成果“Metagenomic exploration of antibiotic resistance genes and their hosts in aquaculture waters of the semi-closed Dongshan Bay (China)”。该研究揭示了福建东山湾近岸海水养殖环境中新型污染物抗生素抗性基因(ARGs)的核心类群及其与宿主的关系，指出近岸海水养殖区域作为陆地与海洋的过渡区，养殖环境存在潜在的新型β-内酰胺酶类(VMB-1-like)抗生素抗性基因，急需开展系统性的海水养殖环境抗生素抗性基因的调查与风险评估。这也是课题组本年度继《Microbiome》（中科院一区top, IF=16.837）后发表的第二篇利用组学技术进行海洋微生物生态学领域研究的top文章。

近岸海水养殖动物已逐渐成为未来人类蛋白质供给的重要来源，然而海水养殖中抗生素残留问题将导致海洋来源食品的粮食安全问题，已引起国际社会的广泛关注。抗生素的应用会对微生物造成选择压力，进而导致微生物抗生素抗性基因(ARGs)的富集，ARGs已被认为是一类新型的环境污染物。近期，《Nature communications》,《Nature Reviews Microbiology》等期刊都发文指出海水养殖环境中ARGs对人类健康造成威胁及对全球经济造成严重损失(Zhang et al., 2021 , Larsson and Flach, 2021 , Reverter et al., 2020)。这些结果表明开展近岸环境尤其是海水养殖环境微生物ARGs的类型及其与宿主的相关研究，对健康养殖具有重要意义。

图文摘要

本研究通过对福建东山湾4个不同季节养殖区及周围非养殖区海水样品宏基因组数据的分析，揭示了ARGs类群和丰度变化，其中核心抗生素抗性基因存在风险性ARGs类群，Gammaproteobacteria是该调查区海水养殖环境携带ARGs的主要宿主，并发现了潜在新β-内酰胺酶(VMB-1-like) 类ARGs的存在。

论文的第一作者为骆祝华研究员与深圳大学李猛教授共同指导的博士后崔国杰，骆祝华研究员与李猛教授为文章的共同通讯作者，重点实验室的徐炜副研究员以及研究生高渊皓、杨帅为文章的共同作者。该研究受到厦门市海洋研究开发院共建项目的主要资助。此外，还受到国家自然科学基金、中东盟海洋合作基金项目、国家重点研发计划、海洋三所基本科研业务费等项目的支持。

自2017年以来，骆祝华研究员课题组在国家重点研发计划和中德海洋科技合作等项目的支持下，在福建东山海水养殖区系统性的开展病原微生物多样性、群落结构、生态分布特征以及暴发风险评估等方面的工作，相关成果已经发表在《Computational and Structural Biotechnology Journal》（中科院2区，IF=7.271）,《Frontiers in Microbiology》（中科院2区top，IF=5.640）等环境微生物领域期刊上，为绿色养殖、健康养殖提供服务支持。

论文链接：

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0048969722028819。

相关发表论文：

1) Guojie Cui, Zongbao Liu, Wei Xu, Yunhao Gao, Shuai Yang, Hans-Peter Grossart, Meng Li*, Zhuhua Luo*, 2022. Metagenomic exploration of antibiotic resistance genes and their hosts in aquaculture waters of the semi-closed Dongshan Bay (China). Science of the Total Environment, 838: 155784.

2) Jie Pan, Wei Xu, Zhichao Zhou, Zongze Shao, Chunming Dong, Lirui Liu, Zhuhua Luo*, Meng Li*, 2022. Genome-resolved evidence for functionally redundant communities and novel nitrogen fixers in the deyin-1 hydrothermal field, Mid-Atlantic Ridge. Microbiome, 10:8.

3) Wei Xu, Wenzhen Lin, Zhichao Wang, Yuanhao Gao, Yu Luo, Hans-Peter Grossart, Yin Guo, Qiancheng Gao, Lixing Huang*, Zhuhua Luo*, 2021. Disentangling the structure and abundance of Vibrio communities in the semi-enclosed bay (Dongshan Bay, Southern China). Computational and Structural Biotechnology Journal, 19: 4381-4393.

4) Wei Xu, Linfeng Gong, Shuai Yang, Yuanhao Gao, Xiaowan Ma, Limei Xu, Chenhai Sheng, Zhuhua Luo*, 2020. Spatiotemporal dynamics of Vibrio communities and abundance in Dongshan Bay, South of China. Frontiers in Microbiology, 11, 575287.